Premieră națională la Cluj: cercetătorii au secvențiat genomul unui dăunător invaziv al fructelor
Educaţie by Actual de Cluj - iul. 16, 2026 0 16
Cercetători din Cluj-Napoca au secvențiat pentru prima dată în România genomul unei populații locale de Drosophila suzukii, insecta cunoscută drept unul dintre cei mai agresivi dăunători ai fructelor. Realizarea a fost anunțată în cadrul unei școli de vară găzduite de Universitatea de Științe Agricole și Medicină Veterinară Cluj-Napoca, organizată în parteneriat cu Universitatea din București.
Secvențierea integrală a genomului, cunoscută sub numele de Whole Genome Sequencing, a pornit de la probe biologice recoltate din stadiul de pupă al insectei, o etapă din dezvoltarea acesteia care nu mai fusese analizată genomic până acum în țară. Tehnologia folosită este Oxford Nanopore Technologies, o metodă modernă de citire a ADN-ului care permite obținerea unor secvențe lungi și analiza detaliată a structurii genomice, arată universitatea clujeană.
Drosophila suzukii este o insectă originară din Asia de Est, care s-a răspândit rapid la nivel mondial începând din anul 2000. Spre deosebire de majoritatea speciilor înrudite, care se dezvoltă doar pe fructele deja aflate în descompunere, aceasta are capacitatea de a depune ouă direct în fructele coapte, ceea ce o transformă într-o amenințare serioasă pentru culturile de arbuști fructiferi și pentru pomicultură. Conform conferențiarului doctor Attila Cristian Rațiu, de la Facultatea de Biologie a Universității din București, existența datelor genomice atât pentru stadiul de pupă, cât și pentru cel de adult, deschide acum posibilitatea studierii diferențelor epigenetice de tip metilare dintre cele două stadii de dezvoltare ale insectei. ”Spre deosebire de majoritatea celorlaltor specii de Drosophila care se dezvoltă numai pe fructele aflate în descompunere, D. suzukii este capabilă să ovipoziteze în fructele coapte, devenind un dăunător major al unei varietăți largi de specii, atât de arbuști fructiferi sălbatici și ornamentali, cât și de specii pomicole. Dispunând deja de datele de secventiere pentru stadiul de adult, cercetătorii pot studia acum diferențele epigenetice, de tip metilare, dintre pupă și adult”, spune el.
Pe lângă această premieră legată de secvențiere, echipa a mai realizat un experiment de transcriptomică pe mutanți unici de Drosophila melanogaster, cunoscută popular drept musculița de oțet, prin care a fost caracterizată o rețea genică centrată pe gena CG18135, rezultat descris ca premieră atât la nivel național, cât și mondial. Pentru evaluarea expresiei genice a fost folosit în premieră în România noul aparat Mic qPCR Cycler, produs de Bio Molecular Systems.
Potrivit profesorului doctor Marius Zăhan, inițiatorul programului, studenții participanți au parcurs toate etapele unui experiment complet de genomică modernă: extracția ADN-ului și ARN-ului, evaluarea calității probelor, secvențierea propriu-zisă prin tehnologia Oxford Nanopore, revers-transcrierea ARN-ului în cDNA, analiza expresiei genice prin Real-Time PCR, precum și procesele de basecalling, asamblare de novo, scaffolding și mapare a datelor genomice obținute.
Școala de vară, intitulată Genomică structurală și funcțională: de la secvențiere Oxford Nanopore Technology la analiză transcriptomică, s-a desfășurat în perioada 13-17 iulie 2026 și s-a adresat studenților din anii doi-patru la specializarea Biotehnologii, precum și masteranzilor și doctoranzilor interesați de tehnologiile actuale din domeniul genomicii, transcriptomicii și bioinformaticii.
